注冊食品公司主要分為工商注冊和食品經營許可證申請兩個階段，具體流程如下：

1. 工商注冊流程

1. 核名：在工商系統提交公司名稱，等待審核通過。

2. 提交注冊申請：上傳法人、股東信息及公司章程，填寫經營范圍。

3. 領取營業執照：工商局審核通過后，發放營業執照。

2. 稅務登記與銀行開戶

- 稅務登記：營業執照領取后30天內，應在稅務部門進行稅務登記，確定納稅類型。

- 銀行開戶：選擇合適銀行開立公司基本賬戶，用于日常資金流轉和經營管理。

3. 食品經營許可證申請

根據《食品安全法》，從事食品生產、銷售或餐飲服務的公司必須申請食品經營許可證。主要步驟包括：

1. 提交申請及資料：包括場地平面圖、設備清單、人員健康證明等。

2. 現場核查：相關部門會對經營場所進行實地檢查，確保符合衛生標準。

3. 領取許可證：審核通過后，可正式開展食品經營業務。

4. 后續相關手續

注冊食品公司后，還需注意以下事項：

- 發票申請：開具增值稅專用發票或普通發票。

- 社保開戶：依法為員工繳納社保和公積金。

- 年度報告：每年按時向工商和稅務部門報送年度報告。